A szegregált iskolák olyan intézmények, amelyek elkülönítve oktatnak valamilyen társadalmilag hátrányos helyzetű csoporthoz tartozó tanulókat. Ezekben az intézményekben nagyobb arányban fordul elő a korai iskolaelhagyás, mivel a tanulók társadalmi hátrányainak koncentrációja negatív hatással van a tanulás eredményességére és az oktatás minőségére. A korai iskolaelhagyás arányát leginkább befolyásoló faktorok közé tartozik a társadalmi háttér, illetve a szülők iskolai végzettsége, a társadalmi-gazdasági helyzet pedig kulcsfontosságú ezen a területen. Ezért a korai iskolaelhagyás megelőzése szempontjából különösen fontosak az oktatási esélyegyenlőséget támogató rendszerszintű stratégiák és szakpolitikai intézkedések.